Zákon, ktorým sa mení a dopĺňa zákon č. 172/1990 Zb. o vysokých školách v znení neskorších predpisov, bol prijatý Národnou radou Slovenskej republiky 11. novembra 1999. Hlavným cieľom je úprava organizácie a riadenia vysokého školstva a posilnenie právomocí akademických senátov a funkcionárov. Kľúčové zmeny zahŕňajú povinnosť, aby študenti tvorili najmenej jednu štvrtinu členov akademického senátu vysokej školy alebo fakulty, a voľbu predsedu akademického senátu z jeho členov. Upravuje sa proces voľby a odvolávania rektora a dekana, kde musí byť kandidát vybraný z rady profesorov a docentov najmenej dva mesiace pred skončením funkčného obdobia pre rektora a jeden mesiac pre dekana. Dôležitou zmenou je aj ustanovenie o finančnom rozdelení, kde sa zohľadňuje hodnotenie práce škôl a fakúlt akreditačnou komisiou. Okrem toho, cudzí študenti na štátnych vysokých školách, ktorí študujú za úhradu, nespadajú pod niektoré ustanovenia § 6 ods. 3. Tieto zmeny majú významný dopad na správu a organizačnú štruktúru vysokých škôl na Slovensku tým, že posilňujú ich autonómiu a zodpovednosť za rozhodovanie.